上城区档案馆的前身是区级机关档案室。1984年10月，杭编[1984]135号“关于建立各城区档案馆和人员编制的通知”，建立区档案馆，归属区委办公室管理。1986年6月，档案馆配备了副馆长。1993年9月，档案馆划归区政府办公室管理。同年11月，配备馆长，定编4人。2005年1月7日，被区委、区政府确定为政务信息公开场所。2006年5月31日，区编委批复建立上城区档案局，局（馆）两块牌子一套班子。